مس در تشکیل کلروفیل، فتوسنتز، متابولیسم کربوهیدراتها و نیتروژن و بالاخره فعال کردن آنزیم‌های مهم گیاهی نقش دارد. مس یکی از اجزای تشکیل دهنده پروتئین کلروپلاست یعنی پلاستوسیانین است. این عنصر همچنین بخشی از زنجیرۀ انتقال الکترون را تشکیل می‌دهد که دو سیستم فتوشیمیایی فتوسنتز را به هم مرتبط می‌سازد.

پروتئین‌های حاوی مس نقش مهمی در فرآیندهایی از قبیل فتوسنتز، تنفس و ساخت لیگنین ایفا می‌نمایند. همچنین مس همانند سایر عناصر غذایی کم مصرف در مقاومت گیاهان به بیماریها نقش ایفا می‌کند. کمبود این عنصر همچنین با تأخیر در گلدهی، خوابیدگی (بخصوص در غلات)، کاهش مقاومت به بیماریها و پژمردگی گیاه به دلیل آسیب در سیستم انتقال آب همراه است.

کود کلات مس خضراء (حاوی 8 درصد مس کلاته) دارای تأثیراتی به شرح زیر است:

1. محلول پاشی زمستانه آن باعث کاهش بیماری‌های قارچی و باکتریایی مانند آتشک درختان میوه دانه دار (خصوصا سیب و گلابی)، پیچیدگی برگ هلو، لکه غربالی درختان میوه هسته دار، شانکر سیتوسپورایی درختان میوه، شانکر باکتریایی درختان میوه هسته دار، پوسیدگی فایتوفترایی طوقۀ درختان میوه هسته‌دار و دانه دار، گموز مرکبات، سرخشکیدگی مرکبات، گموز پسته، لکه آجری بادام، آنتراکنوز گردو و پوسیدگی گل آذین خرما، می‌شود.
2. در برخی از سبزی‌ها به ویژه پیاز سبب کاهش تجمع نیترات در غده و اندام‌های رویشی می‌شود .
3. جلوگیری از عارضه ریز و قرمز شدن برگ و میوۀ پسته.
4. افزایش طول خوشه و پر شدن انتهای خوشه در غلات خصوصاً گندم.
5. غنی سازی یونجه و علوفه (رفع نوعی کم خونی به نام (anemia) در دام‌های تغذیه شده با این یونجه و علوفه)
6. افزایش مقاومت به بیماریها.

کمبود این عنصر موجب تأخیر در گلدهی، خوابیدگی محصول (به خصوص در غلات) و پژمردگی گیاه به دلیل آسیب در سیستم انتقال آب می‌گردد.